DataAtlas Modeler представляет собой комбинированное средство для построения как концептуальной, так и логической модели данных. Modeler позволяет создать структуру данных так, чтобы она могла быть понятна и разработчику баз данных, так и конечному пользователю. Modeler поддерживает подход "сущность-взаимоотношение" (ER) для концептуального моделирования данных. Такой подход использует ER-модели для визуального представления структуры данных. ER-модель отображает данные как сущности, атрибуты и взаимоотношения между сущностями, а также ограничения, накладываемые на использования данных.
Концептуальная модель обеспечивает инфраструктуру для логической модели данных. DataAtlas Modeler отображает ER-модель в структуру данных, которая определяется для каждой конкретной системы управления базами данных. Получающийся в результате этого реляционный дизайн состоит из определения таблиц и их экземпляров.